Да и само сооружение не могло возникнуть из-за обычной эрозии, ведь многие блоки лежат не в тех местах, куда они могли упасть под действием силы притяжения, а выступы и отверстия имеют неприродную форму – овалы, квадраты и ромбы. Возможно, этот объект несет в себе как элементы уникального природного образования, так и следы древней цивилизации.
По мнению Масааки, пирамидам Йонагуни может быть от 3 до 10 тысяч лет, однако неизвестно, какая цивилизация их могла построить, но судя по пробам породы, это место когда-то было над водой.
При дальнейшей работе, профессор тщательно исследовал и измерил подводное сооружение и даже построил макет.
Правительство Японии не признало уникальности этого места и теперь многие дайверы ездят к побережью Йонагуни, чтобы самостоятельно исследовать эту загадку мира.